Em 1994, competia à Direcção de Serviços de Programas e Projectos, através da Divisão de Gestão de Projectos: assegurar a gestão e acompanhamento dos projectos de investigação e desenvolvimento tecnológico financiados pela JNICT; preparar a avaliação de projectos; promover a coordenação dos programas e projectos financiados pela JNICT com os participados por outras instituições, no sentido da racionalização dos meios e dos recursos; apoiar projectos de IDT e de inovação entre unidades de investigação e unidades no sector produtivo; promover a realização de acções de divulgação de C&T.
Através da Divisão de Formação e Apoio à Comunidade Científica competia: assegurar a gestão dos programas de formação e mobilidade de recursos humanos na área de C&T; preparar a avaliação de programas de formação e apoio à comunidade científica; promover a articulação entre os programas de formação da JNICT e de outras instituições, com vista à racionalização de meios e recursos; apoiar a concessão de bolsas de mestrado e doutoramento no País e no estrangeiro; promover a elaboração e edição de textos e publicações de carácter científico e técnico, incluindo teses de doutoramento; promover a participação de investigadores e docentes em congressos, colóquios e outras reuniões científicas e apoiar a realização desses eventos no País. (Decreto-lei n.º 201/94, de 22 de Julho).