A subsérie contém documentação relativa à gestão do Programa CERN - European Organization for Nuclear Research / Organização Europeia para a Pesquisa Nuclear, programa que decorre da adesão de Portugal ao CERN, assinado em 1986, e que implica o pagamento de uma quota anual e a disponibilização de um montante financeiro para apoiar projectos e infraestruturas de C&T.
A documentação reflecte a relação da JNICT com a tutela no que diz respeito à aprovação de projectos e homologação do programa, assim como os contactos com as instituições de I&D com as quais foram celebrados contratos, os guias e relatórios de avaliação do programa e actas de reuniões do Conselho Científico da Comissão Nacional CERN.